同じ駅間なのに、料金が違った件

最初、ミステリーだったのですが。
同僚と、中山（横浜市内）駅から横浜駅経由で新宿までスイカ（パスモ）で帰ってきたのですが、なんと精算金額が違って驚きました。最初、何かの見間違いだと思ったのですが、同僚がふと思いつきました。
「分かった。俺は立川から新宿が定期券区間なので、そちらの安いルートで計算されたんだ。」
うーむ、確かにそうかも知れない。JR の改札機って、なかなか頭良いですね。って、当たり前か。ちなみに、通常は 690円です。同僚は定期区間を引かれて、中山−立川間で計算されたようです。